Peradaban Mykenai runtuh bersamaan dengan kehancuran budaya Zaman Perunggu di kawasan Mediterania timur.
Setelahnya, Yunani memasuki Zaman Kegelapan Yunani—suatu periode transisi tanpa catatan tertulis—yang kemudian mengantarkan pada Yunani Arkais, di mana terjadi pergeseran besar dari sistem terpusat di istana menuju bentuk organisasi sosial-ekonomi yang lebih tersebar, termasuk pemanfaatan besi secara luas.
Berbagai teori dikemukakan mengenai penyebab berakhirnya peradaban ini, di antaranya invasi bangsa Doria atau serangan yang terkait dengan Bangsa Laut.
Teori lain menyebutkan kemungkinan bencana alam atau perubahan iklim sebagai faktor penyebab. Masa Mykenai kemudian menjadi latar sejarah bagi banyak karya sastra dan mitologi Yunani kuno, termasuk Kisah Epik Kuda Troya.***